Jedi cuối cùng đã phát hiện ra sự nghiêng của Palpatine và đối đầu với Thủ tướng. Sidious đả kích với tốc độ chói mắt, vung lưỡi kiếm được ẩn trước đây một cách bất ngờ tấn công đã giết chết tất cả các bậc thầy Jedi Masters Mace Windu đã tập hợp để bắt giữ Thủ tướng. Với sự giúp đỡ của Anakin Skywalker, Sidious đã có thể đánh bại Mace, mặc dù anh ta bị sẹo nặng nề bởi sức mạnh phản ánh của sét bóng tối của anh ta. Để che giấu tầm nhìn đã biến dạng của mình, Sidious trở lại với chiếc áo choàng Sith đơn giản của mình.
Với Anakin cam kết với mặt tối, Sidious đã đưa anh ta là người học việc của mình. Ông đổi tên anh ta Darth Vader và phái anh ta để tiêu diệt Đền Jedi. Sau đó, sử dụng quyền lực của mình với tư cách là Thủ tướng Palpatine, anh đã liên lạc với các chỉ huy Clone nằm rải rác khắp thiên hà để ban hành Đặt hàng 66 - một sắc bí mật, Nghị định điều hành đã xác định mọi Jedi như một kẻ phản bội của Cộng hòa. Những người trung thành nhân bản đã thực hiện các tướng Jedi bị quấy rầy trong máu lạnh.
Sidious sau đó pha chế một câu chuyện về việc biến dạng của mình dưới bàn tay Jedi nổi loạn, và đi trước Thượng viện. Đến cuối bài phát biểu sôi nổi của mình, được hỗ trợ bởi những tràng pháo tay sấm sét của những người yêu nước nhiệt thành, Cộng hòa sẽ không còn nữa. Sidious đã tuyên bố thứ tự mới của mình là Đế chế thiên hà đầu tiên. Bây giờ anh ta được gọi là Hoàng đế Palpatine, người cai trị tối cao của thiên hà.